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Research Papers

1.Original research papers

2017

  1. Qiao Z, Tajim T, Kito F, Arai Y, Kawai A, Kondo T. Metastasis-associated gene signature in primary myxoid liposarcoma identified through a gene expression study. J Electrophoresis. In press.
  2. Qiao Z, Kito F, Takai Y, Oyama R, Kondo T. Secretomics identifies follistatin as a predictive biomarker for response to treatment with tyrosine kinase inhibitors in synovial sarcoma. J Electrophoresis. In press.
  3. Sakumoto M, Takahashi M, Oyama R, Takai Y, Kito F, Shiozawa K, Qiao Z, Yoshida A, Endo M, Kawai A, Kondo T. Establishment and proteomic characterization of NCC-LMS1-C1, a novel cell line of primary leiomyosarcoma in the bone. Jap J Clin Oncol. In press
  4. Kikuta K, Kubata D, Yoshida A, Qiao Z, Morioka H, Nakamura M, Matsumoto M, Chuman H, Kawai A. Discoidin, CUB and LCCL domain-containing protein 2 (DCBLD2) is a novel biomarker of myxofibrosarcoma invasion identified by global protein expression profiling. Biochim Biophys Acta. 2017 Jun 29;1865(9):1160-1166. [PubMed](外部リンク)
  5. Oyama R, Takahashi M, Yoshida A, Sakumoto M, Takai Y, Kito F, Shiozawa K, Qiao Z, Arai Y, Shibata T, Araki Y, Endo M, Kawai A, Kondo T. Generation of novel patient-derived CIC-DUX4 sarcoma xenografts and cell lines. Sci Rep.2017 Jul 5;7(1):4712. [PubMed](外部リンク)
  6. Nakasuji T, Ogonuki N, Chiba T, Kato T, Shiozawa K, Yamatoya K, Tanaka H, Kondo T, Miyado K, Miyasaka N, Kubota T, Ogura A, Asahara H. Complementary Critical Functions of Zfy1 and Zfy2 in Mouse Spermatogenesis and Reproduction. PLoS Genet. 2017 Jan 23;13(1):e1006578. doi: 10.1371/journal.pgen.1006578. eCollection 2017 Jan. [PubMed](外部リンク)
  7. Asano N, Yoshida A, Mitani S, Kobayashi E, Shiotani B, Komiyama M, Fujimoto H, Chuman H, Morioka H, Matsumoto M, Nakamura M, Kubo T, Kato M, Kohno T, Kawai A, Kondo T, Ichikawa H. Frequent amplification of receptor tyrosine kinase genes in welldifferentiated/ dedifferentiated liposarcoma. Oncotarget. 2017 Feb 21;8(8):12941-12952. doi: 10.18632/oncotarget.14652. [PubMed](外部リンク)

2016

  1. Kubota D, Kosaka N, Fujiwara T, Yoshida A, Arai Y, Qiao Z, Takeshita F, Ochiya T, Kawai A, Kondo T. miR-125b and miR-100 Are Predictive Biomarkers of Response to Induction Chemotherapy in Osteosarcoma. Sarcoma. 2016;2016:1390571. [PubMed](外部リンク)
  2. Yamasaki H, Miyamoto M, Yamamoto Y, Kondo T, Watanabe T, Ohta T. Synovial sarcoma cell lines showed reduced DNA repair activity and sensitivity to a PARP inhibitor. Genes Cells. 2016 Aug;21(8):852-60. doi: 10.1111/gtc.12387. [PubMed](外部リンク)
  3. Qiao Z, Pan X, Parlayan C, Ojima H, Kondo T. Proteomic study of hepatocellular carcinoma using a novel modified aptamer-based array (SOMAscan™) platform. Biochim Biophys Acta. 2017 Apr;1865(4):434-443. doi:10.1016/j.bbapap.2016.09.011. Epub 2016 Sep 20. PubMed PMID: 27663888. [PubMed](外部リンク)
  4. Ezawa I, Sawai Y, Kawase T, Okabe A, Tsutsumi S, Ichikawa H, Kobayashi Y, Tashiro F, Namiki H, Kondo T, Semba K, Aburatani H, Taya Y, Nakagama H, Ohki R. Novel p53 target gene FUCA1 encodes a fucosidase and regulates growth and survival of cancer cells. Cancer Sci. 2016 Jun;107(6):734-45. doi:10.1111/cas.12933. Epub 2016 May 16. [PubMed](外部リンク)
  5. Morofuji N, Ojima H, Hiraoka N, Okusaka T, Esaki M, Nara S, Shimada K, Kishi Y, Kondo T. Antibody-based proteomics to identify an apoptosis signature for early recurrence of hepatocellular carcinoma. Clin Proteomics. 2016 Oct 24;13:28. eCollection 2016. [PubMed](外部リンク)
  6. Asano Y, Kawase T, Okabe A, Tsutsumi S, Ichikawa H, Tatebe S, Kitabayashi I, Tashiro F, Namiki H, Kondo T, Semba K, Aburatani H, Taya Y, Nakagama H, Ohki R. IER5 generates a novel hypo-phosphorylated active form of HSF1 and contributes to tumorigenesis. Sci Rep. 2016 Jan 12;6:19174. doi: 10.1038/srep19174. [PubMed](外部リンク)
  7. Takai Y, Matsuo A, Qiao Z, Kondo T. Antitumor activities of BIBF 1120, BI860585, and BI 836845 un preclinical models of sarcoma. Integr Mol Med. 2016 3(4): 755-760, 2016

2015

  1. Tajima T, Kito F, Ohta T, Kawai A, Kondo T. Interactome approach to SBP-1 binding protein in lung adenocarcinoma. J Electrophoresis, 59:1-6, 2015.J Electrophoresis(外部リンク)
  2. Ichikawa H, Yoshida A, Kanda T, Kosugi S, Ishikawa T, Hanyu T, Taguchi T, Sakumoto M, Katai H, Kawai A, Wakai T, Kondo T. Prognostic significance of promyelocytic leukemia expression in gastrointestinal stromal tumor; integrated proteomic and transcriptomic analysis. Cancer Sci. 2015 Jan;106(1):115-24. doi: 10.1111/cas.12565. Epub 2014 Dec 4. [PubMed](外部リンク)
  3. 谷勇樹、ジュネイド・パラヤン、高井庸子、川井章、鵜沼豊、木下英樹、近藤格.全自動二次元電気泳動装置(Auto2D)における狭小幅イモビラインpH勾配ゲルの評価.電気泳動 2015;59:9 doi:10.2198/electroph.59.9[日本電気泳動学会](外部リンク)

2014

  1. Taoka M, Morofuji N, Yamauchi Y, Ojima H, Kubota D, Terukina G, Nobe Y, Nakayama H, Takahashi N, Kosuge T, Isobe T, Kondo T. Global PROTOMAP profiling to search for biomarkers of early-recurrent hepatocellular carcinoma. J Proteome Res. 2014 Jun 26. [Epub ahead of print] PMID: 24967658.[PubMed](外部リンク)
  2. Hosoya N, Sakumoto M, TomitaY, Kondo T. Approach to spot overlapping problem in 2D-PAGE revealed clinical and functional significance of RKIP and MnSOD in renal cell carcinoma. EuPA Open Proteomics 2014 4: 129-139. EuPaA Open Protreomics(外部リンク)
  3. MukaiharaK, Kubota D, Yoshida A, Kawai A, Kondo T. Proteomic profile of epitheliod sarcoma. J Proteomics Bioinform 2014, 7:7 158-165. Proteomics & Bioinformatics(PDF:3670KB)
  4. Ito M, Hagiyama M, Mimae T, Inoue T, Kato T, Yoneshige A, Nakanishi J, Kondo T, Okada M, Ito A. α-Parvin, a pseudopodial constituent, promotes cell motility and is associated with lymph node metastasis of lobular breast carcinoma. Breast Cancer Res Treat. 2014 Feb;144(1):59-69. doi: 10.1007/s10549-014-2859-0. Epub 2014 Feb 5. [PubMed](外部リンク)
  5. Fujiwara T, Katsuda T, Hagiwara K, Kosaka N, Yoshioka Y, Takahashi RU, Takeshita F, Kubota D, Kondo T, Ichikawa H, Yoshida A, Kobayashi E, Kawai A, Ozaki T, Ochiya T. Clinical relevance and therapeutic significance of microRNA-133a expression profiles and functions in malignant osteosarcoma-initiating cells. Stem Cells. 2014 Apr;32(4):959-73. doi: 10.1002/stem.1618. [PubMed](外部リンク)
  6. Kubota D, Yoshida A, Kawai A, Kondo T. Proteomics identified overexpression of SET oncogene product and possible therapeutic utility of protein phosphatase 2A in alveolar soft part sarcoma. J Proteome Res. 2014 May 2;13(5):2250-61. doi: 10.1021/pr400929h. Epub 2014 Mar 31. [PubMed](外部リンク)
  7. Mimae T, Ito A, Hagiyama M, Nakanishi J, Hosokawa Y, Okada M, Murakami Y, Kondo T. A novel approach to pseudopodia proteomics: excimer laser etching, two-dimensional difference gel electrophoresis, and confocal imaging. Protoc exch. 2014 Mar 4;2014. pii: 2014.007. [PubMed](外部リンク)
  8. Kubota D, Yoshida A, Kikuta K, Saito T, Suehara Y, Gotoh M, Kawai A, Kondo T. Proteomic approach to gastrointestinal stromal tumor identified prognostic biomarkers. J Proteomics Bioinform 2014, 7:1 10-16. Proteomics & Bioinformatics(PDF:972KB)
  9. Ichikawa H, Kanda T, Kosugi S, Kawachi Y, Wakai T, Kondo T. Proteomic and meta-transcriptomic study on lymph node metastasis in gastric cancer. EuPA Open proteomics. 2014; 3:183-194. EuPaA Open Protreomics(外部リンク)

2013

  1. Hosoya N, Sakumoto M, Nakamura Y, Narisawa T, Bilim V, Motoyama T, Tomita Y, Kondo T. Proteomics identified nuclear N-myc downstream-regulated gene 1 as a prognostic tissue biomarker candidate in renal cell carcinoma. Biochim Biophys Acta. 2013;1834(12):2630-9. Epub 2013/ 09/ 04. PMID: 23999030.[PubMed](外部リンク)
  2. Kubota D, Yoshida A, Tsuda H, Suehara Y, Okubo T, Saito T, Orita H, Sato K, Taguchi T, Yao T, Kaneko K, Katai H, Kawai A, Kondo T. Gene expression network analysis of ETV1 reveals KCTD10 as a novel prognostic biomarker in gastrointestinal stromal tumor. PloS One. 2013;8(8):e73896. Epub 2013/ 08/ 27. PMID: 23977394.[PubMed](外部リンク)
  3. Kubota D, Mukaihara K, Yoshida A, Tsuda H, Kawai A, Kondo T. Proteomics study of open biopsy samples identifies peroxiredoxin 2 as a predictive biomarker of response to induction chemotherapy in osteosarcoma. J Proteomics. 2013;91C:393-404. Epub 2013/ 08/ 06. PMID: 23911960.[PubMed](外部リンク)
  4. Ichikawa H, Kanda T, Kosugi S. I, Kawachi Y, Sasaki H, Wakai T, Kondo T. Laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis reveal the role of a novel macrophage-capping protein in lymph node metastasis in gastric cancer.J Proteome Res. 2013;12(8):3780-91. Epub 2013/ 06/ 21. PMID: 23782053.[PubMed](外部リンク)
  5. Yonemori H, Kubota D, Taniguchi H, Tsuda H, Fujita S, Murakami Y, Kondo T. Laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis with alkaline isoelectric point immobiline gel reveals proteomic intra-tumor heterogeneity in colorectal cancer. EuPA Open Proteomics. 2013;1:17-29.ScienceDirect(外部リンク)
  6. Arai K, Sakamoto R, Kubota D, Kondo T. Proteomic approach toward molecular backgrounds of drug resistance of osteosarcoma cells in spheroid culture system. Proteomics. 2013;13(15):2351-60. Epub 2013/ 05/ 29. PMID: 23712969.[PubMed](外部リンク)
  7. Kubota D, Mukaihara K, Yoshida A, Suehara Y, Saito T, Okubo T, Gotoh M, Orita H, Tsuda H, Kaneko K, Kawai A, Kondo T. The prognostic value of Pfetin: a validation study in gastrointestinal stromal tumors using a commercially available antibody. Jpn J Clin Oncol. 2013;43(6):669-75. Epub 2013/ 04/ 27. PMID: 23619989.[PubMed](外部リンク)
  8. Kimura K, Ojima H, Kubota D, Sakumoto M, Nakamura Y, Tomonaga T, Kosuge T, Kondo T. Proteomic identification of the macrophage-capping protein as a protein contributing to the malignant features of hepatocellular carcinoma. J Proteomics. 2013;78:362-73. Epub 2012/ 10/ 23. PMID: 23085225.[PubMed](外部リンク)
  9. Huang C, Wang Y, Liu S, Ding G, Liu W, Zhou J, Kuang M, Ji Y, Kondo T, Fan J. Quantitative proteomic analysis identified Paraoxonase 1 as a novel serum biomarker for microvascular invasion in hepatocellular carcinoma. J Proteome Res. 2013;12(4):1838-46. Epub 2013/ 02/ 28. PMID: 23442176.[PubMed](外部リンク)
  10. Haga A, Ogawara Y, Kubota D, Kitabayashi I, Murakami Y, Kondo T. Interactomic approach for evaluating nucleophosmin-binding proteins as biomarkers for Ewing's sarcoma. Electrophoresis. 2013;34(11):1670-8. Epub 2013/ 03/ 14. PMID: 23483572.[PubMed](外部リンク)
  11. Yamamoto T, Nakayama K, Hirano H, Tomonaga T, Ishihama Y, Yamada T, Kondo T, Kodera Y, Sato Y, Araki N, Mamitsuka H, Goshima N. Integrated view of the human chromosome X-centric proteome project. J Proteome Res. 2013;12(1):58-61. Epub 2012/ 12/ 25. PMID: 23259409.[PubMed](外部リンク)
  12. Sugihara Y, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Kubota D, Ichikawa H, Fujita S, Kondo T. Laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis reveal proteomic intra-tumor heterogeneity in colorectal cancer. J Proteomics. 2013;78:134-47. Epub 2012/ 11/ 28. PMID: 23178874.[PubMed](外部リンク)
  13. Hasegawa T, Asanuma H, Ogino J, Hirohashi Y, Shinomura Y, Iwaki H, Kikuchi H, Kondo T. Use of potassium channel tetramerization domain-containing 12 as a biomarker for diagnosis and prognosis of gastrointestinal stromal tumor. Hum Pathol.2013;44(7):1271-7. Epub 2013/ 01/ 08. PMID: 23290008.[PubMed](外部リンク)

2012

  1. Uhlén M, Oksvold P, Älgenäs C, Hamsten C, Fagerberg L, Klevebring D, Lundberg E, Odeberg J, Pontén F, Kondo T, Sivertsson Å. Antibody-based protein profiling of the human chromosome 21. Mol Cell Proteomics. 2012;11(3):M111.013458. PMID: 22042635.[PubMed](外部リンク)
  2. Sugihara Y, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Kubota D, Ichikawa H, Sakamoto K, Nakamura Y, Tomonaga T, Fujita S, Kondo T. Proteomic-based identification of the APC-binding protein EB1 as a candidate of novel tissue biomarker and therapeutic target for colorectal cancer. J Proteomics. 2012;75(17):5342-55. Epub 2012/ 06/ 28. PMID: 22735596.[PubMed](外部リンク)
  3. Morofuji N, Ojima H, Onaya H, Okusaka T, Shimada K, Sakamoto Y, Esaki M, Nara S, Kosuge T, Asahina D, Ushigome M, Hiraoka N, Nagino M, Kondo T. Macrophage-capping protein as a tissue biomarker for prediction of response to gemcitabine treatment and prognosis in cholangiocarcinoma. J Proteomics. 2012;75(5):1577-89. PMID: 22155129.[PubMed](外部リンク)
  4. Mimae T, Tsuta K, Maeshima A. M, Okada M, Asamura H, Kondo T, Tsuda H. Cathepsin D as a potential prognostic marker for lung adenocarcinoma. Pathol Res Pract. 2012;208(9):534-40. Epub 2012/ 07/ 25. PMID: 22824147.[PubMed](外部リンク)
  5. Mimae T, Tsuta K, Kondo T, Nitta H, Grogan T. M, Okada M, Asamura H, Tsuda H. Protein expression and gene copy number changes of receptor tyrosine kinase in thymomas and thymic carcinomas. Ann Oncol. 2012;23(12):3129-37. Epub 2012/ 06/ 16. PMID: 22700994.[PubMed](外部リンク)
  6. Kubota D, Okubo T, Saito T, Suehara Y, Yoshida A, Kikuta K, Tsuda H, Katai H, Shimada Y, Kaneko K, Kawai A, Kondo T. Validation study on Pfetin and ATP-dependent RNA helicase DDX39 as prognostic biomarkers in gastrointestinal stromal tumour. Jpn J Clin Oncol. 2012;42(8):730-41. Epub 2012/ 06/ 23. PMID: 22723667.[PubMed](外部リンク)
  7. Kikuta K, Kubota D, Saito T, Orita H, Yoshida A, Tsuda H, Suehara Y, Katai H, Shimada Y, Toyama Y, Sato K, Kaneko K, Beppu Y, Murakami Y, Kawai A, Kondo T. Clinical proteomics identified ATP-dependent RNA helicase DDX39 as a novel biomarker to predict poor prognosis of patients with gastrointestinal stromal tumor. J Proteomics. 2012;75(4):1089-98. PMID: 22119546.[PubMed](外部リンク)
  8. Ito A, Mimae T, Yamamoto Y. S, Hagiyama M, Nakanishi J, Ito M, Hosokawa Y, Okada M, Murakami Y, Kondo T. Novel application for pseudopodia proteomics using excimer laser ablation and two-dimensional difference gel electrophoresis. Lab Invest. 2012;92(9):1374-85. Epub 2012/ 07/ 04. PMID: 22751350.[PubMed](外部リンク)
  9. Huang C, Ding G, Gu C, Zhou J, Kuang M, Ji Y, He Y, Kondo T, Fan J. Decreased Selenium-Binding Protein 1 Enhances Glutathione Peroxidase 1 Activity and Downregulates HIF-1α to Promote Hepatocellular Carcinoma Invasiveness. Clin Cancer Res. 2012;18(11):3042-53. PMID: 22512980.[PubMed](外部リンク)
  10. Hosako M, Muto T, Nakamura Y, Tsuta K, Tochigi N, Tsuda H, Asamura H, Tomonaga T, Kawai A, Kondo T. Proteomic study of malignant pleural mesothelioma by laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis identified cathepsin D as a novel candidate for a differential diagnosis biomarker. J Proteomics. 2012;75(3):833-44. Epub 2011/ 11/ 05. PMID: 22051404.[PubMed](外部リンク)
  11. Fujii K, Suzuki N, Ikeda K, Hamada T, Yamamoto T, Kondo T, Iwatsuki K. Proteomic study identified HSP 70 kDa protein 1A as a possible therapeutic target, in combination with histone deacetylase inhibitors, for lymphoid neoplasms. J Proteomics. 2012;75(4):1401-10. PMID: 22123078.[PubMed](外部リンク)

2011

  1. Suehara Y, Tochigi N, Kubota D, Kikuta K, Nakayama R, Seki K, Yoshida A, Ichikawa H, Hasegawa T, Kaneko K, Chuman H, Beppu Y, Kawai A, Kondo T. Secernin-1 as a novel prognostic biomarker candidate of synovial sarcoma revealed by proteomics. J Proteomics. 2011;74(6):829-42. PMID: 21385630.[PubMed](外部リンク)
  2. Muto T, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Yonemori H, Chen C, Sugihara Y, Sakamoto K, Kobori Y, Palmer H, Nakamura Y, Tomonaga T, Tanaka H, Mizushima H, Fujita S, Kondo T. Global expression study in colorectal cancer on proteins with alkaline isoelectric point by two-dimensional difference gel electrophoresis. J Proteomics. 2011;74(6):858-73. PMID: 21385629.[PubMed](外部リンク)
  3. Mimae T, Tsuta K, Takahashi F, Yoshida A, Kondo T, Murakami Y, Okada M, Takeuchi M, Asamura H, Tsuda H. Steroid receptor expression in thymomas and thymic carcinomas. Cancer. 2011;117(19):4396-405. PMID: 21437890.[PubMed](外部リンク)
  4. Kubota D, Orita H, Yoshida A, Gotoh M, Kanda T, Tsuda H, Hasegawa T, Katai H, Shimada Y, Kaneko K, Kawai A, Kondo T. Pfetin as a prognostic biomarker for gastrointestinal stromal tumor: validation study in multiple clinical facilities. Jpn J Clin Oncol. 2011;41(10):1194-202. PMID: 21903705.[PubMed](外部リンク)
  5. Hagiwara T, Saito Y, Nakamura Y, Tomonaga T, Murakami Y, Kondo T. Combined use of a solid-phase hexapeptide ligand library with liquid chromatography and two-dimensional difference gel electrophoresis for intact plasma proteomics. Int J Proteomics. 2011;2011:739615. PMID: 22389768.[PubMed](外部リンク)
  6. Gotoh M, Arai E, Wakai-Ushijima S, Hiraoka N, Kosuge T, Hosoda F, Shibata T, Kondo T, Yokoi S, Imoto I, Inazawa J, Kanai Y. Diagnosis and prognostication of ductal adenocarcinomas of the pancreas based on genome-wide DNA methylation profiling by bacterial artificial chromosome array-based methylated CpG island amplification. J Biomed Biotechnol. 2011;2011:780836. PMID: 21197409.[PubMed](外部リンク)
  7. Arai E, Wakai-Ushijima S, Fujimoto H, Hosoda F, Shibata T, Kondo T, Yokoi S, Imoto I, Inazawa J, Hirohashi S, Kanai Y. Genome-wide DNA methylation profiles in renal tumors of various histological subtypes and non-tumorous renal tissues. Pathobiology. 2011;78(1):1-9. PMID: 21474971.[PubMed](外部リンク)

2010

  1. Shibata T, Kokubu A, Miyamoto M, Hosoda F, Gotoh M, Tsuta K, Asamura H, Matsuno Y, Kondo T, Imoto I, Inazawa J, Hirohashi S. DEK oncoprotein regulates transcriptional modifiers and sustains tumor initiation activity in high-grade neuroendocrine carcinoma of the lung. Oncogene. 2010;29(33):4671-81. PMID: 20543864.[PubMed](外部リンク)
  2. Ojima H, Yoshikawa D, Ino Y, Shimizu H, Miyamoto M, Kokubu A, Hiraoka N, Morofuji N, Kondo T, Onaya H, Okusaka T, Shimada K, Sakamoto Y, Esaki M, Nara S, Kosuge T, Hirohashi S, Kanai Y, Shibata T. Establishment of six new human biliary tract carcinoma cell lines and identification of MAGEH1 as a candidate biomarker for predicting the efficacy of gemcitabine treatment. Cancer Sci. 2010;101(4):882-8. PMID: 20088962.[PubMed](外部リンク)
  3. Nishiyama N, Arai E, Chihara Y, Fujimoto H, Hosoda F, Shibata T, Kondo T, Tsukamoto T, Yokoi S, Imoto I, Inazawa J, Hirohashi S, Kanai Y. Genome-wide DNA methylation profiles in urothelial carcinomas and urothelia at the precancerous stage. Cancer Sci. 2010;101(1):231-40. PMID: 19775289.[PubMed](外部リンク)
  4. Kikuta K, Tochigi N, Saito S, Shimoda T, Morioka H, Toyama Y, Hosono A, Suehara Y, Beppu Y, Kawai A, Hirohashi S, Kondo T. Peroxiredoxin 2 as a chemotherapy responsiveness biomarker candidate in osteosarcoma revealed by proteomics. Proteomics Clin Appl. 2010;4(5):560-7. PMID: 21137073.[PubMed](外部リンク)
  5. Kikuta K, Gotoh M, Kanda T, Tochigi N, Shimoda T, Hasegawa T, Katai H, Shimada Y, Suehara Y, Kawai A, Hirohashi S, Kondo T. Pfetin as a prognostic biomarker in gastrointestinal stromal tumor: novel monoclonal antibody and external validation study in multiple clinical facilities. Jpn J Clin Oncol. 2010;40(1):60-72. PMID: 19815537.[PubMed](外部リンク)
  6. Akishima-Fukasawa Y, Ino Y, Nakanishi Y, Miura A, Moriya Y, Kondo T, Kanai Y, Hirohashi S. Significance of PGP9.5 expression in cancer-associated fibroblasts for prognosis of colorectal carcinoma. Am J Clin Pathol. 2010;134(1):71-9. PMID: 20551269.[PubMed](外部リンク)

2009

  1. Yamada M, Fjii K, Koyama K, Hirohashi S, Kondo T. The proteomic profile of pancreatic cancer cell lines corresponding to carcinogenesis and metastasis. J Proteomics Bioinform. 2009;2(1):1-18. PMID: 1000057.(外部リンク)
  2. Uemura N, Nakanishi Y, Kato H, Saito S, Nagino M, Hirohashi S, Kondo T. Transglutaminase 3 as a prognostic biomarker in esophageal cancer revealed by proteomics. Int J Cancer. 2009;124(9):2106-15. PMID: 19142970.[PubMed](外部リンク)
  3. Uemura N, Nakanishi Y, Kato H, Nagino M, Hirohashi S, Kondo T. Antibody-based proteomics for esophageal cancer: Identification of proteins in the nuclear factor-kappaB pathway and mitotic checkpoint. Cancer Sci. 2009;100(9):1612-22. PMID: 19558549.[PubMed](外部リンク)
  4. Tsuta K, Kato Y, Tochigi N, Hoshino T, Takeda Y, Hosako M, Maeshima A. M, Asamura H, Kondo T, Matsuno Y. Comparison of different clones (WT49 versus 6F-H2) of WT-1 antibodies for immunohistochemical diagnosis of malignant pleural mesothelioma. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2009;17(2):126-30. PMID: 19516197.[PubMed](外部リンク)
  5. Suehara Y, Kikuta K, Nakayama R, Fujii K, Ichikawa H, Shibata T, Seki K, Hasegawa T, Gotoh M, Tochigi N, Shimoda T, Shimada Y, Sano T, Beppu Y, Kurosawa H, Hirohashi S, Kawai A, Kondo T. Anatomic site-specific proteomic signatures of gastrointestinal stromal tumors. Proteomics Clin Appl. 2009;3(5):584-96.(外部リンク)
  6. Suehara Y, Kikuta K, Nakayama R, Fujii K, Ichikawa H, Shibata T, Seki K, Hasegawa T, Gotoh M, Tochigi N, Shimoda T, Shimada Y, Sano T, Beppu Y, Kurosawa H, Hirohashi S, Kawai A, Kondo T. GST-P1 as a hitological biomarker of synovial sarcoma revealed by proteomics. Proteomics Clin Appl. 2009;3(5):623-34.(外部リンク)
  7. Kosaihira S, Tsunehiro Y, Tsuta K, Tochigi N, Gemma A, Hirohashi S, Kondo T. Proteome expression database of lung adenocarcinoma: a segment of the genome medicine database of Japan proteomics. J Proteomics Bioinform. 2009;2(11):463-5. PMID: 1000106.(外部リンク)
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  9. Kikuta K, Tsunehiro Y, Yoshida A, Tochigi N, Hirohashi S, Kawai A, Kondo T. Proteome expression database of Ewing sarcoma: a segment of the genome medicine database of Japan proteomics. J Proteomics Bioinform. 2009;2(12):500-4. PMID: 1000112.(外部リンク)
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2.和文論文

  1. 谷勇樹、ジュネイド・パラヤン、高井庸子、川井章、鵜沼豊、木下英樹、近藤格.全自動二次元電気泳動装置(Auto2D)における狭小幅イモビラインpH勾配ゲルの評価.電気泳動 2015;59:9 doi:10.2198/electroph.59.9[日本電気泳動学会](外部リンク)

3.英文著書

2017

  1. Kondo T. Omics approach for identifying predictive biomarkers in osteosarcoma. Osteosarcoma – Biology, Behavior and Mechanisms. InTech, 2017, DOI:10.5772/67449(外部リンク)

2016

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2015

  1. Kondo T. Novel prognostic biomarker, pfetin, in gastrointestinal stromal tumors: proteomics study. General Methods in Biomarker Research and Their Applications. Vol. 1, pp251-266, Series Editor: Victor R. Preedy, Springer, ISBN 978-94-007-7695-1

2009

  1. Kondo T, Hirohashi S. Application of 2D-DIGE in cancer proteomics toward personalized medicine. Methods Mol Biol. 2009;577:135-54. PMID: 19718514.[PubMed](外部リンク)

4.和文著書

2015

  1. 近藤格.「二次元電気泳動法を用いたがんバイオマーカー開発」 遺伝医学MOOK オミクスで加速するがんバイオマーカ研究の最新動向 メディカルドゥ ISSN 1349-2527 63-71

2013

  1. 近藤 格. 「骨軟部腫瘍のプロテオーム解析」先端医療シリーズ44 臨床医のための最新整形外科. 株式会社寺田国際事務所/先端医療技術研究所. 2013:12-5.(外部リンク)
  2. 近藤 格. 「DIGE道場」ライフサイエンスアカデミー

2012

  1. 近藤 格. 「プロテオーム解析」 新臨床腫瘍学 がん薬物療法専門医のために 改訂第3版. 南江堂. 2012:71-3.(外部リンク)
  2. 近藤 格.「手術生組織」,「探索的解析手法」臨床プロテオミクス. バイオマーカー探索から個別化医療へ. 金原出版. 2012:75-80,118-24.(外部リンク)

2010

  1. 近藤 格. 「蛍光二次元電気泳動法(2D-DIGE法)を用いた正常・腫瘍組織からのプロテオーム解析」 創薬・タンパク質研究のためのプロテオミクス解析. 羊土社. 2010:125-33.(外部リンク)
  2. 近藤 格. 「プロテオーム解析によるがんバイオマーカー開発」 体外診断用医薬品の開発と承認申請. 技術情報協会. 2010:293-300.

2009

  1. 近藤 格, 廣橋 説雄. 「がんのプロテオミクス」 新臨床腫瘍学 がん薬物療法専門医のために 改訂版. 南江堂. 2009:98-101.
  2. 近藤 格. 「癌バイオマーカー探索のための蛍光二次元電気泳動法」細胞工学別冊 明日を拓く新次元プロテオミクス-医学生物学を変える次世代技術の威力-.学研メディカル秀潤社. 2009:101-15.(外部リンク)
  3. 近藤 格. 「GeMDBJ Proteomics 二次元電気泳動法による癌プロテオームデータベース」 細胞工学別冊 バイオリソース&データベース活用術. 学研メディカル秀潤社. 2009:46-50.(外部リンク)
  4. 近藤 格. 「二次元電気泳動法を用いたタンパク質の発現解析」 やさしい原理から入るタンパク質科学実験法III タンパク質のはたらきを知る-分子機能と生体作用. 化学同人. 2009:106-13.(外部リンク)
  5. 近藤 格. 「プロテオーム解析による肝細胞癌のバイオマーカーの開発」 最新医学64巻9月増刊号 臨床遺伝子学'09 -がんの遺伝子学-. 最新医学社. 2009:125-32.(外部リンク)

2006

  1. 近藤 格, 廣橋 説雄. 「がんのプロテオミクス」 新臨床腫瘍学 がん薬物療法専門医のために. 南江堂. 2006:83-6.

2005

  1. 近藤 格. 「レーザーマイクロダイセクションとプロテオーム解析」「 疾患プロテオミクスのためのバイオインフォマティクス」「最新疾患プロテオミクス研究の現状と展望-先端ラボ報告- 大腸初期発癌の発現プロテオーム解析」 遺伝子医学MOOK2号 疾患プロテオミクスの最前線-プロテオミクスで病気を治せるか-. メディカルドゥ. 2005: 52-7,137-9..(外部リンク)

2004

  1. 近藤 格, 廣橋説雄.「二次元電気泳動による発現解析」実験医学別冊 決定版プロテオーム解析マニュアル. 羊土社. 2004:26-43.(外部リンク)
  2. 近藤 格, 廣橋 説雄. 「二次元電気泳動法による発現解析―蛍光ラベルされたタンパク質の二次元電気泳動」 実験医学別冊 注目のバイオ実験シリーズ 決定版!プロテオーム解析マニュアル 発現解析・機能解析の最新プロトコールからデータ整理,トラブル対処法まで. 羊土社. 2004:26-43.(外部リンク)

2002

  1. 近藤 格, 清家 正博, 森 康治, 藤井 一恭, 山田 哲司, 廣橋 説雄. 「二次元電気泳動を用いた癌のプロテオーム解析」 実験医学別冊 注目のプロテオミクスの全貌を知る!-最新手法とその応用成果 質量分析、構造解析、相互作用解析、バイオイメージング、バイオインフォマティクス-. 羊土社. 2002.(外部リンク)

5.英文総説

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6.和文総説

総説(日本語)

2017

  1. 近藤格「悪性胸膜中皮腫のプロテオーム解析」「悪性胸膜中皮腫UPDATE」企画:廣島健三、多田裕司、医学のあゆみ261巻第2号145-149

2016

  1. 近藤格「プロテオーム解析によるがんのバイオマーカー開発」血液内科 72(4):520-523, 2016
  2. 近藤格「プロテオーム解析によるがんバイオマーカー開発」生物試料分析 39(2):169-175, 2016
  3. 近藤格「希少がんを研究するということ」CLINIC magazineクリニックマガジン 4月号 No. 562, 30-31, 2016
  4. 近藤格「プロテオーム解析によるがんバイオマーカー開発」生物試料分析39巻2号169-174, 2016

2015

  1. 近藤格「網羅的解析による希少がんの新規治療法の開発:バイオマーカー開発から治療標的探索へ」呼吸34(5): 485-490, 2015.
  2. 近藤格「プロテオーム解析によるバイオマーカー開発におけるmRNAデータを用いたメタ解析」「電気泳動のフロンティア2015」編集:志村清仁、近藤格、木下英司、Electrophoresis Letters Vol. 59, No.2, 118-120, 2015

 2014

  1. 近藤格「蛍光二次元電気泳動法を用いたがんのバイオマーカー開発」「特集 最新の電気泳動技術」編集:大石正道、近藤格、Electrophoresis Letters Vol. 58, No.2, 46-48, 2014. 
  2. 近藤格「肉腫のプロテオーム解析」「臨床プロテオミクス」企画:近藤格、医学のあゆみ 251巻10号949-952.
  3. 近藤格「プロテオミクスによる消化管間質腫瘍の研究:予後予測のためのバイオマーカー「フェチン」の発見と検証実験」BIOTOVE 2014:20, 2-5.

2013

  1. 近藤 格. 「蛍光二次元電気泳動法のポイント」実験医学 数理的アプローチで迫るがんの本当の姿. 羊土社. 2013: 2985-90. 
  2. 近藤 格. 「プロテオーム解析による骨軟部腫瘍の研究」SOFT TISSUE SARCOMA Journal. グラクソ・スミスクライン株式会社. 2013; 3 : 9-10
  3. 近藤 格. 「高度に学際的な研究としての疾患プロテオーム研究を目指して」Labcab vol.4. 株式会社サグブレイン. 2013: 23-4.
  4. 近藤 格. 「プロテオーム解析における電気泳動法の活用」 医療と検査機器・試薬. ラボサービス/宇宙堂八木書店. 2013: 297-3002. 

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 2011

  1. 近藤 格. 「癌プロテオーム解析の10年とこれから」BioExpress. 2011: 2-7.
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2007

  1. 近藤 格. 「がんのプロテオーム解析」BioExpress. 2007.
  2. 近藤 格. 「癌のプロテオーム解析によるバイオマーカー開発の現状と将来の展望」細胞工学 バイオマーカーが医療・創薬戦略を変える. 学研メディカル秀潤社. 2007; 26(9): 1039-44. 

 2006

  1. 近藤 格.「 疾患プロテオミクスと蛍光ディファレンスゲル二次元電気泳動」生物物理化学. 2006; 50: 155-63.
  2. 近藤 格. 「二次元電気泳動法と質量分析のための組織試料の調製法(特集1 プロテオーム研究を成功させる試料調製と解析法)」バイオテクノロジージャーナル. 羊土社. 2006; 6(2):153-6. 

 2005

  1. 清家 正博, 近藤 格, 廣橋 説雄. 「蛍光二次元電気泳動に関わる技術的進歩とその応用-2D-DIGEとLaser microdissection」The Lung perspectives. メディカルレビュー. 2005; 13(4):428-32. 
  2. 近藤 格, 廣橋 説雄. 「臨床応用を目指した肺がんのプロテオミクス」The Lung perspectives. メディカルレビュー. 2005; 13(4): 368-72.
  3. 近藤 格. 「プロテオミクスによる癌の悪性形質を裏付けるタンパク質群の同定~オーダーメイド医療のための腫瘍マーカーの開発へ向けた試み」実験医学. 羊土社. 2005; 23(7): 1078-82. 
  4. 近藤 格. 「バイオインフォマティックスを用いた疾患Omicsによる疾患マーカーの開発」臨床検査. 医学書院. 2005;49(12):1524-6. 

 2004

  1. 近藤 格. 「がん研究におけるプロテオーム解析-腫瘍マーカー開発に向けた二次元電気泳動法の応用-」 生化学. 2004; 76(4): 385-90.
  2. 近藤 格. 「二次元電気泳動を用いた臨床マーカーの開発 必要とされる技術開発と臨床研究への応用」生物物理化学. 日本電気泳動学会. 2004; 48(3): 89-91. 

 2003

  1. 近藤 格. 「腫瘍マーカー開発のためのプロテオミクス」生体の科学. 医学書院. 2003; 54(5): 420-7.